Stando a Famitsu, le vendite di Pokémon Rubino Omega e Zaffiro Alpha hanno raggiunto le 1.534.593 unità durante i suoi primi tre giorni di commercializzazione in Giappone.Queste cifre portano il titolo ad essere il quarto gioco con il miglior lancio per 3DS nella terra del Sol Levante, seguendo Pokémon X e Y, Monster Hunter 4 e Monster Hunter 4 Ultimate.
Anche le vendite della console portatile Nintendo hanno visto un incremento, passando dai 51.000 pezzi della scorsa settimana agli oltre 83.000 di questa.