In Assassin’s Creed III ci saranno molte sezioni con protagonista Desmond. Lo ha detto il lead writer del gioco Matt Turner: “tutto quello che posso dire sulla storyline di Desmond è che si passerà molto tempo in sezioni ambientate nel presente, come mai prima d’ora nella serie. E’ una grossa parte della storia, quindi non anticipo nulla perché voglio che i giocatori la vedano con i loro occhi, ma una cosa è certa: si vedrà Desmond per molto tempo, molto più che nei giochi precedenti“.